Вам необходимо воспользоваться любым из способов:
При помощи графического интерфейса
Установите сертификат в зависимости от формата вашего ключа:
Установка .pfx (экспортированный ключ с закрытой частью)
Необходимо:
- Открыть «Инструменты КриптоПро», вкладка «Сертификаты»;
- Нажать «Импортировать ключи».
По умолчанию при импорте ключ копируется на ваш ПК. Если требуется использовать сертификат на съёмном носителе, его нужно скопировать на носитель и после установить;
- Перейти в место хранения сертификата, выбрать его и нажать «Открыть»;
- Ввести пароль от сертификата, заданный при выгрузке, и нажать «ОК»;
- В новом окне можно задать пароль на сертификат. Если пароль не нужен, оставить поля пустыми и нажать «ОК»;
- Сертификат появится в списке сертификатов.
Установка .cer (только открытая часть)
Необходимо:
- Открыть «Инструменты КриптоПро», вкладка «Сертификаты»;
- Нажать «Показать расширенные» и поставить галку «Отключить автовыбор хранилища (использовать текущее)».
Если галку не ставить, «КриптоПро» автоматически будет определять хранилище для сертификатов. Личные сертификаты попадут в хранилище «Другие пользователи»;
- Перейти в выпадающем меню в нужное хранилище сертификатов и нажать «Установить сертификаты»;
- Перейти в место хранения сертификата, выбрать его и нажать «Открыть»;
- Окно закроется, на вкладке появится строка с установленным сертификатом.
Установка из .key (скопированные с носителя 6 файлов ключа)
Необходимо:
- Скопировать папку с файлами в папку локального хранения контейнеров «КриптоПро», по умолчанию «/var/opt/cprocsp/keys/имя_пользователя»;
- После переноса ключи автоматически появятся на вкладке «Контейнеры» в «Инструментах КриптоПро»;
- Выбрать на вкладке «Контейнеры» нужный сертификат и нажать «Установить сертификат». Появится сообщение «Сертификат был успешно установлен»;
- После установки сертификат появится на вкладке «Сертификаты».
Установка сертификата с токена\флэш-накопителя:
Необходимо:
- Подключить накопитель или токен к вашему ПК;
- В «Инструментах КриптоПро» перейти на вкладку «Контейнеры» и выбрать нужный контейнер на носителе;
- Нажать «Установить сертификат»;
- После установки сертификат появится на вкладке «Сертификаты».
Установка открытой части в контейнер закрытого ключа
Выполнить команду:
/opt/cprocsp/bin/amd64/certmgr -inst -inst_to_cont -ask-container -pin "пин-код токена" -file “путь к файлу сертификата”
Пример:
/opt/cprocsp/bin/amd64/certmgr -inst -inst_to_cont -ask-container -pin "12567" -file /path/to/certificate.cer
Установка корневых сертификатов и списков отзыва
Установка корневого сертификата удостоверяющего центра
Вам необходимо воспользоваться любым из способов:
Через терминал
Выполнить команду:
/opt/cprocsp/bin/amd64/certmgr -inst -cert -file ~/Загрузки/.cer -store uRoot
Через графический интерфейс
Необходимо:
- Открыть «Инструменты КриптоПро», нажать «Показать расширенные»;
- Поставить галку «Отключить автовыбор хранилища (использовать текущее)»;
- В выпадающем меню выбрать «Доверенные корневые центры сертификации»;
- Нажать «Установить сертификаты», в открывшемся меню найти файл сертификата центра сертификации и нажать «Открыть»;
- Может появиться сообщение-предупреждение о том, что установка корневых сертификатов несет риск безопасности. Нужно нажать «ОК»;
- Внизу окна появится сообщение «Установка завершена». Если его развернуть, появится информация о совершенном действии.

Установка списка отозванных сертификатов
Выполнить команду:
/opt/cprocsp/bin/amd64/certmgr -inst -crl -file ~/Загрузки/.crl
Установка цепочки промежуточных сертификатов
Выполнить команду:
/opt/cprocsp/bin/amd64/certmgr -inst -cert -file ~/Загрузки/.p7b -store CA
и получайте новости первыми!