Конечно. Ни бухгалтерский, ни налоговый учёт не содержат запрета на начисление амортизации, также нет и разрешения прекратить амортизацию.  У вас реконструкция ещё не начата, поэтому обязательно продолжайте начислять амортизацию.
и получайте новости первыми!